Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNRPNP63162 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms