Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RAB1AP62820 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB1AP62820 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms