Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ERVFC1P60507 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms