Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CABP4P57796 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CABP4P57796 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CABP4P57796 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CABP4P57796 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms