Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms