Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CASP7P55210 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CASP7P55210 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP7P55210 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CASP7P55210 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CASP7P55210 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP7P55210 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms