Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP98P52948 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP98P52948 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP98P52948 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP98P52948 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP98P52948 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP98P52948 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP98P52948 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms