Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP5P51878 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP5P51878 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP5P51878 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP5P51878 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP5P51878 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP5P51878 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CASP5P51878 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CASP5P51878 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP5P51878 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP5P51878 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CASP5P51878 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP5P51878 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP5P51878 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP5P51878 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP5P51878 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms