Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SMARCA2P51531 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SMARCA2P51531 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms