Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC34P49427 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDC34P49427 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC34P49427 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms