Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NESP48681 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NESP48681 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NESP48681 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NESP48681 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NESP48681 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NESP48681 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NESP48681 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NESP48681 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NESP48681 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NESP48681 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NESP48681 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NESP48681 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NESP48681 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NESP48681 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NESP48681 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NESP48681 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NESP48681 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NESP48681 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
NESP48681 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NESP48681 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NESP48681 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NESP48681 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NESP48681 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NESP48681 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms