Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP5P45974 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP5P45974 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP5P45974 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP5P45974 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP5P45974 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP5P45974 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms