Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LTBRP36941 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LTBRP36941 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LTBRP36941 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LTBRP36941 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTBRP36941 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LTBRP36941 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LTBRP36941 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms