Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA4P34932 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA4P34932 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms