Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSG3P32926 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSG3P32926 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG3P32926 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG3P32926 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG3P32926 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSG3P32926 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSG3P32926 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms