Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LMOD1P29536 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMOD1P29536 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms