Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID4AP29374 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ARID4AP29374 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms