Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LAP3P28838 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms