Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTSSP25774 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTSSP25774 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTSSP25774 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTSSP25774 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTSSP25774 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTSSP25774 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms