Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PRPH2P23942 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRPH2P23942 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms