Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
VAMP1P23763 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VAMP1P23763 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms