Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCL3P20749 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BCL3P20749 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BCL3P20749 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BCL3P20749 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BCL3P20749 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BCL3P20749 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms