Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HOXA5P20719 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HOXA5P20719 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms