Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMY2BP19961 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMY2BP19961 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms