Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DESP17661 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DESP17661 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
DESP17661 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
DESP17661 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DESP17661 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DESP17661 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DESP17661 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms