Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ITGA2P17301 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ITGA2P17301 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms