Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTLA4P16410 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms