Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPGDP15428 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HPGDP15428 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HPGDP15428 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms