Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HOXB3P14651 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms