Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRG2P13727 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRG2P13727 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PRG2P13727 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms