Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BMP3P12645 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BMP3P12645 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BMP3P12645 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BMP3P12645 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BMP3P12645 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BMP3P12645 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BMP3P12645 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BMP3P12645 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms