Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGAMP11215 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms