Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRFP10586 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRFP10586 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms