Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GLI3P10071 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GLI3P10071 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GLI3P10071 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GLI3P10071 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GLI3P10071 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GLI3P10071 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GLI3P10071 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GLI3P10071 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI3P10071 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI3P10071 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI3P10071 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI3P10071 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI3P10071 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms