Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF888P0CJ79 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms