Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms