Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ACAA1P09110 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACAA1P09110 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms