Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HSP90AB1P08238 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HSP90AB1P08238 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms