Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MSMBP08118 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MSMBP08118 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMBP08118 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMBP08118 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMBP08118 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMBP08118 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MSMBP08118 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMBP08118 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMBP08118 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMBP08118 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMBP08118 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMBP08118 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MSMBP08118 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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