Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOP08100 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOP08100 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOP08100 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOP08100 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOP08100 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOP08100 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOP08100 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOP08100 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOP08100 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOP08100 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOP08100 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOP08100 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOP08100 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOP08100 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOP08100 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOP08100 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOP08100 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms