Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM2P07951 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM2P07951 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms