Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CBX7O95931 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX7O95931 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX7O95931 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX7O95931 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX7O95931 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX7O95931 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CBX7O95931 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CBX7O95931 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms