Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX58O95786 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX58O95786 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX58O95786 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DDX58O95786 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DDX58O95786 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms