Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
ABCC9O60706 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC9O60706 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms