Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CUBNO60494 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CUBNO60494 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUBNO60494 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUBNO60494 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUBNO60494 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUBNO60494 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUBNO60494 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUBNO60494 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CUBNO60494 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUBNO60494 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CUBNO60494 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUBNO60494 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CUBNO60494 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUBNO60494 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CUBNO60494 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUBNO60494 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUBNO60494 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms