Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CXCL13O43927 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms