Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HTATSF1O43719 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HTATSF1O43719 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms