Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DENRO43583 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DENRO43583 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DENRO43583 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms