Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP3O43295 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP3O43295 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms