Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FANCAO15360 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FANCAO15360 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FANCAO15360 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FANCAO15360 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FANCAO15360 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FANCAO15360 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FANCAO15360 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms